2025年10月1日，深圳大學(xué)高等研究院李猛教授團(tuán)隊(duì)在Environmental Science & Technology在線(xiàn)發(fā)表題為“Temporal and Spatial Dynamics of Microbial Community Composition and Functional Potential in Mangrove Wetlands over a Seven-Year Period”的論文。研究圍繞深圳福田紅樹(shù)林國(guó)家自然保護(hù)區(qū)，開(kāi)展2017—2023年的多組學(xué)長(zhǎng)期觀(guān)測(cè)，系統(tǒng)解析生態(tài)退化與分階段修復(fù)背景下沉積物微生物群落的結(jié)構(gòu)、功能與進(jìn)化響應(yīng)。李猛為通訊作者，博士后戚雁玲為第一作者，合作單位包括深圳大學(xué)與中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)。

研究整合81份宏基因組與72份宏轉(zhuǎn)錄組，在沉積物中重構(gòu)8474個(gè)微生物基因組，覆蓋13個(gè)古菌門(mén)與70個(gè)細(xì)菌門(mén)，其中約95%為潛在新物種。群落結(jié)構(gòu)主要受沉積深度與季節(jié)更替驅(qū)動(dòng)；功能層面隨修復(fù)推進(jìn)，有機(jī)碳氧化、硫酸鹽還原、反硝化與固氮等關(guān)鍵通路的基因轉(zhuǎn)錄顯著增強(qiáng)，指示厭氧代謝能力與元素循環(huán)功能同步提升。進(jìn)化分析顯示群落中普遍存在純化選擇，且環(huán)境波動(dòng)與基因組大小是選擇壓力的重要決定因子。值得關(guān)注的是，研究在Thermoplasmatota門(mén)內(nèi)提出一候選綱，并依據(jù)SeqCode命名為CandidatusShennongiarchaeia（原EX4484-6，注冊(cè)條目i:49837）。該命名致敬上古“神農(nóng)”（“嘗百草”典故），呼應(yīng)該類(lèi)群潛在的厭氧與兼性異養(yǎng)特征、可能的生物活性化合物合成能力及其生態(tài)意義。

紅樹(shù)林濕地微生物群落與功能潛力的七年時(shí)空動(dòng)態(tài)

本研究以紅樹(shù)林修復(fù)為情境，揭示沉積物微生物在生態(tài)恢復(fù)推進(jìn)中由結(jié)構(gòu)、功能到進(jìn)化壓力的系統(tǒng)性重構(gòu)，為沿海濕地保護(hù)與修復(fù)評(píng)估提供微生物學(xué)指標(biāo)與長(zhǎng)期基線(xiàn)，并為闡釋紅樹(shù)林藍(lán)碳能力與污染調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。研究獲得廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究重大項(xiàng)目、中國(guó)博士后科學(xué)基金、國(guó)家自然科學(xué)基金、深圳大學(xué)2035卓越研究計(jì)劃以及深圳大學(xué)合成生物學(xué)研究中心的支持。

論文鏈接：https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.est.5c01564